- mega下载
- 版本:v7.0.14
- 类别:办公软件
- 大小:30.9MB
- 时间:2024-11-17
软件介绍
Mega是一款实际操作十分简单的细胞生物学分析系统,页面十分友善,即便 新手也非常容易入门。而且
它可以接纳多种多样数据格式,如FASTA格式、Phylip格式、PAUP数据格式这些。并且Mega软件专业
出示了把别的格式的数据交换为Mega数据格式的程序流程。Mega可用以序列比照、进化树的推论、
可能分子结构演变速率、认证演变理论等。还能够根据NCBI开展序列的核对和数据信息的检索,是一款
专业软件。
Mega构建系统软件进化树的流程:
1.要将用以构建系统软件进化树的全部序列合拼到同一个fasta格式文档,留意:全部序列的方位都
要保持一致。
2.开启Mega软件,挑选"Alignment"-"Alignment Explorer/CLUSTAL",在提示框中挑选Retrieve
sequences from a file,随后点一下OK,寻找准备好的序列文档并开启。
3.在开启的对话框中挑选“Alignment”-"Align by ClustalX"开展两端对齐,两端对齐全过程必须一段时间
,两端对齐进行后,最好是将序列两边切齐,挑选两边参差不齐的一部分,单击右键,挑选delete就可以。
4.关掉当今对话框,关掉的情况下会提醒2次是不是储存,第一次不在乎,储存不储存都能够,第二
次一定要储存,储存的文档格式是.meg。依据提醒键入Title,随后会出現一个提示框了解是不是
是Protein-coding nucleotide sequence data,依据状况挑选yes or no。最终出現一个提示框
了解是不是开启,挑选yes。
5.返回mega主对话框,在工具栏中挑选"Phylegeny"-"Bootstrap Test of
Phylogeny"-"Neighbor-joining",开启一个对话框,里边有很多主要参数能够设定,怎么设置这种参
数请参照详尽的Mega使用说明,不容易设定就姑且应用初始值,不必改动,点一下下边的Compute按键
,系统软件进化树就画出来。
6.在工具栏中挑选“Phylogeny”-"Bootstrap Test Of Phylogeny"-"Minimun-evoluntion"。
7.在工具栏中挑选“Phyligeny”-"Bootetrap Test Of Phylogeny"-"Minimun-parsimony"。
8.在工具栏中挑选“Phyligeny”-"Bootstrap Test Of Phylogeny"-"UPGMA"。
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